DBD fusion (bait) vectors' polylinkers:

 

pEG202 (aka pLexA, displayBait); pGilda


        SmaI*         SalI         NotI           SalI  
 EcoRI        BamHI         NcoI*           XhoI 
GAA TTC CCG GGG ATC CGT CGA CCA TGG CGG CCG CTC GAG TCG AC

pEG202-92

                BamHI                  EcoRI                              SalI   
GAA TTg act agt gga tcc ccg ggc tgc agg aat tcg ata tca agc tta tcg ata ccG TCG AC
E   L   T   S   G   S   P   G   C   R   N   S   I   S   S   L   S   I   P   S 
 

pNLexA

          NotI           BamHI  
 EcoRI            XhoI    
g aat tcg cgg ccg cct cga ggg atc caa ttc ATG AAA
  N   S   R   P   P   R   G   I   Q   F   M   K 
 

pLexZeo

 EcoRI                                ApaI             NotI          SalI* 
                 SacI           PvuII          KpnI            XhoI          PstI  
gaa ttC AAG CTT GAG CTC AGA TCT CAG CTG GGC CCG GTA CCG CGG CCG CTC GAG TCG ACc tgc ag
E   F   E   L   R   S   Q   L   G   P   V   P   R   P   L   E   S   T   C 
 

AD fusion (library) vectors' polylinkers:

 

pJG4-5 (aka pB42AD, displayTarget)


     EcoRI           XhoI 
CCC GAA TTC GGC CGA CTC GAG AAG CTT
P   E   F   G   R   L   E   K   L

 

pJG4-5 AAT frame

               NcoI            SmaI           EcoRI           XhoI  
CCC GAA TTG TCC ATG GGG ATC CCC CGG GCT GCA GGA ATT CGG CCG ACT CGA GAA
P   E   L   S   M   G   I   P   R   A   A   G   I   R   P   T   R   E
 

pYesTrp2

                              KpnI           BamHI
                   HinDIII          SacI 
ATG GGT AAG CCT ... AAG CTT GGT ACC GAG CTC GGA TCC ACT AGT AAC GGC
M   G   K   P       K   L   G   T   E   L   G   S   T   S   N   G

                  EcoRI                              NotI            SphI  
       BstXI                             BstXI               XhoI 
CGC CAG TGT GCT GGA ATT CTG CAG ATA TCC ATC ACA CTG GCG GCC GCT CGA GGC ATG C
R   Q   C   A   G   I   L   Q   I   S   I   T   L   A   A   A   R   G   M   H
 

pGKS polylinkers:


Upstream region of cI gene:
tcc gtt gtg ggg aaa gtt atc gct agt cag tgg cct gaa gag acg ttt gg
S   V   V   G   K   V   I   A   S   Q   W   P   E   E   T   F   G

  followed by:

 

 

A = AAT frame
 

        HinDIII          BglII         ApaI*            NotI          SalI* 
 EcoRI               SacI       PvuII          KpnI            XhoI*          PstI* 
G AAT TCA AGC TTG AGC TCA GAT CTC AGC TGG GCC CGG TAC CGC GGC CGC TCG AGT CGA Cct gca g
  N   S   S   L   S   S   D   L   S   W   A   R   Y   R   G   R   S   S   R   P   A 

 
B = GAA frame        Note: HinDIII site is eliminated

          EcoRI           BglII         ApaI*            NotI          SalI* 
                   SacI           PvuII         KpnI             XhoI*         PstI* 
G AAT Ttg gaa ttC GAG CTC AGA TCT CAG CTG GGC CCG GTA CCG CGG CCG CTC GAG TCG ACc tgc ag
  N   L   E   F   E   L   R   S   Q   L   G   P   V   P   R   P   L   E   S   T   C
 

C = ATT frame        Note: HinDIII site is eliminated

            EcoRI          BglII         ApaI*            NotI          SalI* 
                    SacI            PvuII         KpnI             XhoI*         PstI*
G AAT TTG GGA ATT CGA GCT CAG ATC TCA GCT GGG CCC GGT ACC GCG GCC GCT CGA GTC GAC CTG CAG
  N   L   G   I   R   A   Q   I   S   A   G   P   G   T   A   A   A   R   V   D   L   Q
  

 
Note:sites with the asterisks (*) are not unique on some plasmids. SmaI cannot be used on either pEG202 or pMW plasmids. NcoI is not unique on pMW103 plasmid. HinDIII, ApaI, XhoI, SalI and PstI are not unique on pGKS8 plasmids. PstI also cannot be used on pGMS11 and pGMS12 plasmids.